توزیع فلاکس های متابولیک محتمل در رشد یا تولید محصول سلولی
پایان نامه
- وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه علم و صنعت ایران - دانشکده مهندسی شیمی
- نویسنده فرناز ستوده
- استاد راهنما فرشته نعیم پور
- تعداد صفحات: ۱۵ صفحه ی اول
- سال انتشار 1384
چکیده
برنامه ریزی خطی lp روش قدرتمندی برای یافتن جواب بهینه در طیف وسیعی از مسایل مختلف از جمله مسایل مختلف از جمله مسایل نظامی، مدیریتی ، فرایندی ، پزشکی و غیره می باشد. یکی از مسایل موجود در lp وجود جواب های متعدد در شرایطی است که همه این جواب ها منجر به تابع هدف بهینه و یکسان می گرددد degeneracy اگرچه در اینحالت جواب یکتای بهینه برای مساله وجود ندارد ولی در بسیاری از موارد انعطاف پذیری زیادی در تصمیم گیری ها ایجاد نموده که به نوبه خود قدرت انتخاب از بین جواب های بهینه را بوجود می آورد. یکی از مباحث مطرح در بیوتکنولوژی مدل سازی رفتار سلول ها از نظر رشد یا تولید محصول می باشد. از آنجا که مطالعات آزمایشگاهی در این زمینه نیامند صرف هزینه های بسیار زیادی می باشد. روش های محاسباتی مانند بهینه سازی در تعیین فلاکس های درون سلولی بکار گرفته می شود این روش ها در طراحی بهینه تولید محصول مطلوب و یا جلوگیری از تشکیل محصولا جانبی و نامطلوب مورد استفاده قرار می گیرند. برنامه ریزی خطی یکی از روش های محاسبه فلاکس های درون سلولی می باشد. مانند تتمام مسایل بهینه سای در اینحالت نیز احتمال وجود جواب های متعدد وجود دارد تعیین این جواب های متعدد می تواند ا نظر عملیاتی در دستکاری های ژنتیکی و انعطاف پذیری آن ها از اهمیت ویژه ای برخوردار باشد. در این تحقیق پس از مدل سازی با استفاده از مراجع موجود رشد یا تولید محصول در باکتری صنعتی استرپیتومایسس تولید کننده بیش از دو سوم آنتی بیوتیک های میکروبی به بررسی توزیع فلاکس های متابولیکی و بررسی احتمال وجود جواب های متعدد شبکه متابولیکی این میکروارگانیسم پرداخته شده است. مدل متابولیکی استرپتومایسس با داشتن 157 متغیر حقیقی مربوط به فلاکس واکنش ها و 112 معادله موازنه جرم برای متابولیت های درون سلولی درنرم افزارهای gams و lingo برای بهینه نمودن رشد سلولی حل گردید. حداکثر شدت رشد به ازای شدت مصرف ویژه گلوکز 100 umole (gdw h)-1 مقدار 0.0118995 g(g dw h)-1 محاسبه شد و مشخص شد که جواب های متعددی برای رسیدن برا ی مشخص نمودن مسیرهای مختلف مورد استفاده قرار گرفت. با اعمال این الگوریتم بش از 3000 متغیر صحیح بصورت صفر-یک به سیستم اضافه و با استفاده از روش milp حل گردید. 16 مسیر مختلف شناسایی شد. بررسی نتایج بدست آمده نشان می دهد که مسیرهای محتمل در ای شبکه بسیار نزدیک به هم می باشند و تفاوت قابل توجهی مشاهده نمی شود
منابع مشابه
اثر تیتانیوم بر رشد و تولید رنگیزه های فتوسنتزی جلبک تک سلولی Dunaliella salina
تیتانیوم عناصر ضروری نمی¬باشد ولی گزارش¬شده است که می¬تواند منجر به بهبود متابولیسم زیستی در گیاهان شود. دراین تحقیق اثر تیتانیوم بر روند رشد و رنگیزه¬ها ، میزان فتوسنتز و تنفس جلبک دونالیه¬لا در یک دوره رشد مورد بررسی قرار گرفت. به این منظور غلظت¬های 100، 150و 200 میکرومولار تیتانیوم در سه تکرار و شاهد بر گونهD. salina اعمال و سپس میزان کلروفیل، بتاکاروتن و همچنین تقسیم سلولی در یک دوره¬ی رشد...
متن کاملتولید آزمایشگاهی فاکتور رشد اپیدرم انسانی نوترکیب و ارزیابی عملکرد آن در بقای سلولی
Background and purpose: Human epidermal growth factor (hEGF) is a polypeptide of 53 amino acids with various medical application such as wound healing. The purpose of this study was cloning, expression, and purification of recombinant human EGF (rhEGF) and assessment of its mitogenic effect on NIH 3T3 cells. Materials and methods: Subcloninig of hEGF was performed in to pET24a (+). Protein e...
متن کاملافزایش تولید هورمون رشد انسانی نوترکیب در سلول‌های CHO از طریق کنترل شرایط کشت سلولی
هدف: هدف این مطالعه افزایش تولید هورمون رشد انسانی توسط اضافه کردن ترکیبات شیمیایی به محیط کشت فاقد سرم سلول‌های CHO و بررسی خواص hGH تولید شده می‌باشد. مواد و روش‌ها: در این مطالعه، تاثیر تیمارهای مختلف شامل غلظت‌های مختلف گلیسرول،DMSO ، NaBu و ZnSO4 در سلول‌های CHO مورد بررسی قرار گرفت و تولید GH بهروش الایزا سنجیده شد.سلول‌ها به هر چاهک یک پلیت 12 خانه حاوی DMEM-F12 و FBS10 درصد اضافه شدند...
متن کاملافزایش تولید هورمون رشد انسانی نوترکیب در سلول های cho از طریق کنترل شرایط کشت سلولی
هدف: هدف این مطالعه افزایش تولید هورمون رشد انسانی توسط اضافه کردن ترکیبات شیمیایی به محیط کشت فاقد سرم سلول های cho و بررسی خواص hgh تولید شده می باشد. مواد و روش ها: در این مطالعه، تاثیر تیمارهای مختلف شامل غلظت های مختلف گلیسرول،dmso ، nabu و znso4 در سلول های cho مورد بررسی قرار گرفت و تولید gh بهروش الایزا سنجیده شد.سلول ها به هر چاهک یک پلیت 12 خانه حاوی dmem-f12 و fbs10 درصد اضافه شدند....
متن کاملبهینه سازی فرایند رشد تک بلورهای ktp در محیط فلاکس
از آنجا که بلورهای ktp یکی از بهترین بلورهای غیر خطی برای تولید هماهنگ دوم برای کاربردهای نظامی، پزشکی، صنعتی و مخایراتی است رشد این بلورها با کیفیتی خوب دارای اهمیت است و این امر فقط با بهینه سازی پارامترهای موثر در فرایند رشد این بلورها امکان پذیر است. در این پژوهش ما از روش رشد خودبخودی استفاده کردیم و با بهینه کردن پارامترهایی چون شکل بوته، گرادیان دمایی در طول بوته، آهنگ سرد کردن کوره(محلو...
15 صفحه اولمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
نوع سند: پایان نامه
وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه علم و صنعت ایران - دانشکده مهندسی شیمی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023